Logiciels

MERGEZ A., RACOUPEAU M., KLOPP C., GASPIN C., LEGEAI F., CHOULET F.

MAGATT est un pipeline Snakemake qui permet de transférer une annotation structurale d'un génome de référence vers un autre génome nouvellement séquencé.

Equipe PaleoEvo: Clea Siguret, Margaux Olivier, Cécile Huneau, Mamadou Dia Sow, Christophe Klopp, Marie-Laure Martin, Jean-Philippe Tamby, Peter Civan, Caroline Pont, Olivier Mathieu, Jerome Salse

Interface web publique PlantSyntenyViewer:Flores R, Huneau C, Burlot L, Lainé M, Kimmel E, Pommier C, Alaux M, Adam-Blondon AF, Pont C, Quesneville H, Salse J.

Danguy des Déserts A, Durand N, Servin B, Goudemand-Dugué E, Alliot JM, Ruiz D, Charmet G, Elsen JM, Bouchet S

Plateforme BIOINFO

Equipe DiGen

Plateforme BIOINFO

P. Leroy, N. Guilhot, A. Bernard

The characterization of paleo-duplications in five species belonging to three of the agronomically most important subfamilies of grasses permitted us to propose a model for an ancestral genome.