Validation fonctionnelle

Présentation générale

La plateforme ValFon met en oeuvre les outils des biotechnologies pour répondre à des questions scientifiques, et réalise des recherches méthodologiques pour améliorer ces outils.

De nos jours, la transformation génétique, ainsi que les nouvelles techniques d’édition des génomes sont devenues des outils incontournables de la génomique fonctionnelle. Ils se révèlent particulièrement utiles pour étudier et valider les fonctions de gènes préalablement identifiés par des études de cartographie génétique, ou encore pour étudier les mécanismes de régulation de l’expression des gènes. Ils permettent également d’induire de façon très précise des mutations sur un gène prédéfini, afin par exemple, d’évaluer son impact sur un caractère d’intérêt. La maitrise de ces technologies est donc particulièrement importante pour la recherche et ses applications en agronomie

Les activités de la plateforme sont réparties entre deux principaux objectifs.

1.  Répondre, sous forme de collaborations scientifiques aux demandes de validation de gènes émanant des différents laboratoires, français ou étrangers, travaillant sur la génomique du blé. Pour cela, nous avons

• Développé une technique de transformation par biolistique, qui présente l'avantage de permettre la transformation d'un grand nombre de variétés différentes, couplée à l'utilisation de cassettes de transformation pour éliminer toute trace de plasmide et simplifier les profils d'insertion par biolistique.
• Mis au point une procédure permettant de tester la capacité de variétés/espèces nouvelles à la transformation.
• Mis en place un atelier de constructions moléculaires, basé sur la technologie Gateway, qui permet la réalisation de vecteurs de transformation complexes.

1. Contribuer aux développements et innovations technologiques en rapport avec la transgénèse, à travers notre participation à plusieurs projets collaboratifs qui ont pour objectif :

• La mise au point de techniques d’édition du génome à l’aide de la  technologie  CRISPR-Cas9 et des technologies dérivées (PIA GENIUS, PEPR SV)      
• Le développement de technique de civ permettant l’utilisation de nouveaux types d’explants utilisables pour l’obtention de plantes transformées (Plant2Pro MAESTRO)
• L’utilisation des techniques de base editing pour l’amélioration de la qualité du blé (EpiFree) ou l’augmentation de la diversité génétique (Vaccin)
• L’utilisation de la technologie Vigs, qui exploite les mécanismes de défense antiviral des plantes, et permet d’étudier l’expression d’un gène ou d’une famille de gènes, sans produire de plantes génétiquement modifiées (ACCES)

Prestations de la plate-forme :

• Construction de vecteurs de transformation pour la biolistique ;
• Culture In Vitro
• Obtention de plantes de blé transformées et/ou éditées ;
• Analyse moléculaire des plantes transformées.
• Formation aux techniques de transformation génétique et civ
• Accueil d’étudiants et scolaires, encadrement d'étudiants en thèse (une HDR)
• Participation au dialogue sciences/société

Moyens à disposition :

La plate-forme est dotée d'équipements permettant l'obtention et la culture de plantes génétiquement modifiées et répondant aux normes actuellement en vigueur.

Elle dispose également de tous les équipements nécessaires à l'analyse des plantes transformées :

• laboratoire de biologie moléculaire
• une salle PCR
• 2 pièces de CIV dont 1 équipée de deux canons à particules Biorad
• 3 salles climatisées pour la régénération de plantules par civ
• 3 chambres de culture en conditions contrôlées, type P1
• 1 serre type S1 de 300 m2
• 1 serre type S2 de 300 m2