Volet 1 : Macro-évolution

L’accumulation récente de ressources génomiques végétales a fourni une occasion sans précédent de comparer les génomes modernes entre eux et de déduire leur histoire évolutive à partir de l’étude des génomes de leurs plus récents ancêtres communs (MRCA). Outre l'inférence du génome ancestral des monocotylédones, des eudicotylédones et des angiospermes, des génomes ancestraux ont été reconstruits pour les lignées d'angiospermes telles que les graminées, les rosacées, les brassicacées, les légumineuses et les cucurbitacées. Les génomes ancestraux inférés sont non seulement cruciaux pour comprendre comment les génomes de plantes, en particulier les espèces polyploïdes, ont évolué aux échelles des chromosomes et des gènes, mais offrent également la possibilité de réaliser de manière novatrice la recherche translationnelle des espèces modèles aux espèces cultivées.

Plant genome evolution from reconstructed ancestors. The present-day monocot (right side, with grasses on a green background) and eudicot (left panel, on a pink background) genomes (bottom) are represented with color codes to illustrate the evolution of genomic segments from their founder ancestors (AAK, ancestral angiosperm karyotype; ABK, ancestral Brassicaceae karyotype; ACuK, ancestral Cucurbitaceae karyotype; AEK, ancestral eudicot karyotype; AGK, ancestral grass karyotype; ALK, ancestral legume karyotype; AMK, ancestral monocot karyotype; ARK, ancestral Rosaceae karyotype) over the time scale shown on the left (in mya). The polyploidization events that have shaped the structure of modern plant genomes during their evolution from inferred ancestors are indicated by red dots (duplication) and blue dots (triplication).

Référence principale du groupe :
Murat F, Armero A, Pont C, Klopp C, Salse J (2017) Reconstructing the genome of the most recent common ancestor of flowering plants. NATURE GENETICS. 49(4): 490-496